家蠶經過人類長期絭養，對於疾病極為敏感，只要溫濕度控制不好，在有病原菌污染之下，很容易發生疾病。

家蠶常見的疾病，屬於真菌性病害有白殭病、綠殭病、黑殭病、麴黴病及微粒子病等。以白殭菌、綠殭菌最容易發生，病原菌主要由蠶體表感染，侵入體內後，使蠶死亡，死亡約2天後體表節間及氣孔周圍出現白色絹絲狀菌絲，並再次產生分生孢子。

細菌性病害則最常見的猝倒病，是由蘇力菌（Bacillus thuringiensis）引起，主因為蠶吃下含有蘇力菌孢子後，其在蠶的鹼性腸道中釋出殺蟲結晶蛋白，使蠶體滲透壓改變造成死亡。

另外最另養蠶農家頭痛的問題就是軟化病與膿病。膿病是由核多角體病毒（NPV）、引起，傳染力極強，病蠶所流出的體液、糞便及屍體，都會有具感染力的病毒顆粒，因此病毒常會殘存在蠶座或蠶具上，使得反覆感染，難以去除。軟化病亦是由病毒所引起，主要病徵是蠶體感染後會變軟逐漸腐爛，但其致病病原可能有多種，但較常發生的為質多角體病毒（CPV）所引起，其感病途徑與膿病大致相同，一旦開始發病，很容易透過病蠶迅速傳播給其他個體。因此做好蠶室與蠶具的消毒，預防蠶病的發生，是養蠶工作最重要的事。

感染核多角體病毒（NPV）之病蠶，活動力不佳